Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms