Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q8CDS7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8CDS7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms