Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo43Q8CDI2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo43Q8CDI2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms