Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8C3W1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms