Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slx1bQ8BX32 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slx1bQ8BX32 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms