Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms