Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Catsper4Q8BVN3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Catsper4Q8BVN3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms