Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms