Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cep55Q8BT07 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep55Q8BT07 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms