Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdhaf3Q8BQU3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sdhaf3Q8BQU3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms