Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
5730596B20RikQ8BQ08 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms