Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gga3Q8BMI3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms