Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo38Q8BMI0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxo38Q8BMI0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms