Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zcchc4Q8BKW4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms