Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms