Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc9Q8BJN4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fndc9Q8BJN4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms