Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Atg4bQ8BGE6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Atg4bQ8BGE6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Atg4bQ8BGE6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Atg4bQ8BGE6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg4bQ8BGE6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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