Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.2Q85ZW9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms