Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Atg4cQ811C2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg4cQ811C2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Atg4cQ811C2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Atg4cQ811C2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Atg4cQ811C2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Atg4cQ811C2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Atg4cQ811C2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Atg4cQ811C2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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