Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NfascQ810U3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfascQ810U3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms