Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim19Q80ZU4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms