Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TnnQ80Z71 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TnnQ80Z71 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms