Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll4Q80V24 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll4Q80V24 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms