Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec18aQ7TSQ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms