Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdp1Q7TSG2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdp1Q7TSG2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms