Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prrc2bQ7TPM1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms