Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk40Q7TNL3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stk40Q7TNL3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms