Protein–RNA interactions for Protein: Q7M760

Zranb1, Ubiquitin thioesterase Zranb1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb1Q7M760 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zranb1Q7M760 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zranb1Q7M760 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms