Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TwistnbQ78WZ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms