Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme8Q715T0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme8Q715T0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms