Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SpopQ6ZWS8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SpopQ6ZWS8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms