Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Syne1Q6ZWR6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Syne1Q6ZWR6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms