Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ncapd3Q6ZQK0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ncapd3Q6ZQK0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms