Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm3bQ6ZPY7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm3bQ6ZPY7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms