Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms