Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcl3Q6W5C0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms