Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timd4Q6U7R4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms