Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY1

Fchsd1, F-BAR and double SH3 domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd1Q6PFY1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fchsd1Q6PFY1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fchsd1Q6PFY1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms