Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RimklaQ6PFX8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RimklaQ6PFX8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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RimklaQ6PFX8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RimklaQ6PFX8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RimklaQ6PFX8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RimklaQ6PFX8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RimklaQ6PFX8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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