Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf4Q6PFF0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf4Q6PFF0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms