Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms