Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trak1Q6PD31 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trak1Q6PD31 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms