Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2mQ6P6I6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms