Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nwd2Q6P5U7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nwd2Q6P5U7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nwd2Q6P5U7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nwd2Q6P5U7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nwd2Q6P5U7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms