Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms