Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pprc1Q6NZN1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pprc1Q6NZN1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pprc1Q6NZN1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pprc1Q6NZN1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pprc1Q6NZN1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pprc1Q6NZN1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pprc1Q6NZN1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms