Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rprd2Q6NXI6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms