Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
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