Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q6DFW0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6DFW0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q6DFW0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms