Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thsd7aQ69ZU6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms